种子萌发过程中，有机物的数量会逐步减少然后再逐步增加，但是有机物的种类和水分却会增多。在种子刚刚萌发的时候，它是进行呼吸作用的，会消耗一些有机物，但是种子长出绿色叶子后，就可以进行光合作用了，有机物数量就会增加。
种子在种子表皮还没有破裂的时候，它是无氧呼吸的，而呼吸作用实在细胞质基质中进行的，当种子表皮破裂后，就是有氧呼吸了。这个时候，肯定会消耗一些有机物，自然有机物的数量就会减少了。
种过植物的人都知道，植物是有一段萌发期的，它一开始只是种子而已，之后会逐渐长出绿色叶子。有了绿叶子，就容易进行光合作用了，当种子萌发的绿叶进行光合作用之后，它就会沉淀出有机物，有机物的数量会增多，而且水分也会增多。
植物进行光合作用，是必须在有光照的条件下进行的，会更利于植株营养物质的沉淀，让植株的叶绿素更多，经过光和碳化物反应，可以将吸收到的二氧化碳与水转化为有机物，并且还可以释放出新鲜的氧气出来，同时光合作用会让叶片更加鲜绿。