水中叶绿素a分析仪具有操作舒适、测试方便、应用场合广泛的优点。叶绿素a本身对环境没有危害，但它是估算浮游植物生物量的重要指标，可以通过测定水中浮游植物叶绿素a的含量，掌握水体的初级生产力情况和富营养化水平，在环境监测中，叶绿素a含量是评价水体富营养化的指标之一。
叶绿素a是植物光合作用中的重要光合色素，其含量可以反映植物的生长状况。叶绿素a属于合成天然低分子有机化合物，不溶于水，溶于有机溶剂，如丙酮、乙醚、氯仿等。在水环境的富营养化研究中，叶绿素a的含量是表征浮游植物生物量的最常用指标之一。如今广泛应用于水质评价和水体富营养化评价等方面，水质监测技术规范中明确规定湖泊水库叶绿素属于常规监测项目。