目前，我们希望通过检测水中磷、氮等营养物质的含量来了解河流、湖泊、水库等地表水体是否富营养化，也可以通过观察水中藻类繁殖来判断。水中藻类的繁殖是通过检测水中的叶绿素a来确定水体是否富营养化。众所周知，水体富营养化的主要表现是水中藻类的大量繁殖，而所有的藻类都含有叶绿素a，所以藻类a的含量可以通过水体中叶绿素a的含量来判断。
在自然条件下，湖泊也会从贫乏的营养状态富营养状态，但这一自然过程非常缓慢，由于工业废水和生活污水中含有营养物质的人为排放而引起的水体富营养化可能会在短时间内出现。当水体富营养化现象出现时，漂浮的藻类会大量繁殖，水花的颜色因漂浮的藻类而异，水面通常呈现蓝色、红色、棕色、乳白色等现象，在海洋中称为赤潮或红潮。
水中叶绿素a分析仪可以通过检测水体中叶绿素a的含量，从而有效地控制藻类的生长数量。